تبدأ الحكاية داخل معهد "البروفيسور إكس" السري، حيث يجتمع مراهقون متحورون يمتلكون قدرات خارقة ومرعبة، يحاولون جاهدين إخفاء هوياتهم والعيش كطلاب ثانوية طبيعيين وسط مجتمع يخشاهم! لكن السلام لا يدوم، فبينما يتدربون بقيادة "وولفرين" و"سايكلوبس" لحماية العالم، تظهر "أخوية المتحورين" الأشرار بقيادة "ميستيك" لإشعال حرب شوارع طاحنة، تليها المؤامرة الكبرى من المغناطيسي "ماغنيتو". تنفجر الأحداث عندما ينكشف سر المتحورين علنًا أمام البشرية، ليتحول الخوف إلى مطاردات واضطهاد رسمي، وتصل الإثارة لـذروتها مع استيقاظ العدو الأزلي "أبوكاليبس"؛ متحور قديم لا يقهر يسعى لإبادة البشرية واستعباد الجميع، مما يجبر الأبطال والأشرار على الاتحاد في تحالف أخير ومصيري لإنقاذ كوكب الأرض من دمار محتم!